Los signos de calidad son una estrategia muy utilizada en los paises del sur de Europa para promocionar productos con caracteristicas difernciales. Pero la enorme profusion de los signos realcionados con el origen esta provocando un efecto contrario al pretendido, ya que el mensaje que transmiten es cada vez menos claro para el consumidor. Entre las diferentes soluciones que emregen recientemente ante este problema, destacan las llamdas marcas de segunda generacion ligadas a procesos de desarrollo rural territorial. El objetivo de este articulo es presentar una metodologia original, elaborada especificamente para la evaluacion de estas marcas. El trabajo revisa los retos metodologicos que se han tenido que superar para abordar este tipo de evaluacion. La aplicacion empirica ha consistido en la validacion de la metodologia propuesta, al ser probada satisfactoriamente en una muestra de 15 territorios con marca de calidad territorial. Quality labelling is a strategy that is widely used in southern European countries to promote products with differential characteristics. However, the profusion of origin-related labels is causing the opposite effect as the message they convey is becoming increasingly less clear to consumers. The various solutions recently proposed to overcome this problem include what is know as second-generation labels linked to territorial rural development processes. In this paper we present an original methodology to evaluate these labels and review the methodological challenges in undertaking an evaluation of this type. The suitability of the methodology proposed has been empirically proved in a sample of fifteen territories involved in a territorial quality label joint project.