En este trabajo se realiza un análisis comparado de dos métodos no paramétricos de medida de productividad total de los factores con datos de panel basados en programación: índices de Malmquist y un modelo DEA intertemporal que permite acotar las medidas de eficiencia y progreso técnico, suponiendo cambio técnico no regresivo. La aplicación se realiza sobre las agriculturas de los países de la Unión Europea, encontrándose algunas diferencias importantes entre ambos enfoques. Los resultados sugieren menor crecimiento de productividad agraria y, sobre todo, una ordenación distinta de países en relación con dichos crecimientos que los encontrados en otros trabajos. Palabras clave: Productividad, DEA, Agricultura, Europa, Datos de panel. SUMMARY This paper compares two non-parametric programming techniques for the measurement of total factor productivity using panel data: Malmquist indices and an intertemporal-DEA model that allows the calculation of technology and efficiency levels bounds, assuming non-regressive technical change. Both methodologies are applied to the analysis of agricultural productivity in the European Union countries, and several important divergences between models are found. The results suggest lower productivity increases in agriculture than those found in recent literature, with different country ranking concerning productivity growth.